Los diclonius son seres manipulados geneticamente que adquieren un sexto sentido, un poder devastador. Permanecen en un laboratorio donde son estudiados, pero una nocho,Lucy, escapa del laboratorio matando a varios de los guardias en su paso.

Esacapo del lugar pero es herida, al despertar se encuentra en una playa sin tener memoria alguna de quien es. Dos estudiantes, Kouta y Yuka, la encuentran y deciden dejarla vivir con ellos nombrandola Nyu por se lo unico que dice, pero lo que no saben es que la personalidad malvada de lucy no a desaparecido.