Chou Hatsumei Boy Kanipan es la continuacion de la historia de Hatsumei Boy Kanipan. Kanipan es ahora un adolescente, y sigue siendo un inventor famoso. Pero un dia, una nave misteriosa cayo del cielo y se estrello en la playa. Dentro de ella habia una humaoide que habia perdido la memoria y no recordaba abosultamente nada de ella misma. Sera tarea de Kanipan regresarle la memoria a la humanoide, y accidentalmente descubre que el planeta esta en terrible peligro..